啤酒殺菌的目的是保證啤酒長期保存的生物穩定性。
巴氏殺菌是迄今為止最常見的消毒方法，由法國科學家 Louis D. 發明，由巴斯德 (1822-1895) 發明。啤酒的殺菌溫度一般為60~62C，時間為10~20min。如果溫度只是稍微升高，殺死微生物所需的時間就會呈指數下降。溫度越高，殺菌時間越短。對于50℃以上的殺菌溫度，每升高7℃，殺菌時間可縮短9/10，即在相同殺菌時間下，溫度每升高7℃，殺菌單元增加10倍。瓶裝和罐裝啤酒，尤其是出口啤酒，需要進行巴氏殺菌。
路易斯巴斯德提出了計算滅菌單位的經驗公式。產品產生的殺菌單位是時間和溫度的函數。巴氏殺菌單位是指將啤酒在60℃保溫1min所獲得的殺菌效果為1PU值。即通過巴氏殺菌單元（PU）來衡量殺菌效果，使用巴氏殺菌單元（PU）測試儀可以準確控制殺菌單元。
PU=1.393（殺菌溫度60）×殺菌時間（分鐘）
根據PU值公式，可以計算出1min在不同溫度下處理的PU值。滅菌單元用后續記錄儀進行測量，當它通過滅菌器時，容器內外的探頭會記錄處理溫度。啤酒的巴氏殺菌單位要求在15-25PU之間。使用的巴氏殺菌裝置越小，啤酒的味道就越好。但出于安全原因，大多數啤酒廠通常將其保持在上限。

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